Ni que decir tiene que me he vuelto un maniático a la hora de maquetar una web y conseguir que se vea igual de bien en los navegadores principales (no veas que subidón para el EGO) y el problema de Opera me empezaba a desesperar un poco.

Hoy, por casualidad he descubierto que poniendo esto en la hoja de estilos, conseguimos solucionar el problema.

/** Hack para el scroll doble de opera **/
@media all and (-webkit-min-device-pixel-ratio:10000), not all and (-webkit-min-device-pixel-ratio:0)
{
   html { overflow: auto; }

   body { overflow: auto; }
}

Espero que sirva de utilidad.